授業の
到達目標
（ディプロマポリシーとの関連）
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バイオテクノロジーは情報生物学を駆使して行われている。そこで、本講義では遺伝子データベースの活用について、共同データベースの利用方法の基礎を学ぶ（DP2)。
特に、遺伝子配列データベースと使えること（DP2)。
タンパク質データベースを使えること（DP2)。
メタボロームデータベースなどの利用ができること（DP7)。
バイオテクノロジーを総合的に理解できることが到達目標である（DP7)。
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授業概要
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ＮＣＢＩ紅葉データベースの使い方から、ＰＣＲプライマーの配列設計まで、ありとあらゆるバイオテクノロジー実験ツールがインターネットを介して使える状態にある。そこで、これらのデータベースなどの中から基本的な必須ツールを抽出して、その使い方を学ぶことで、バイオテクノロジーの理解を深める。
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教育課程内の位置づけ
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環境教育学科 専門教育科目 専門応用科目 ３年 選択科目
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授業におけるアクティブな特徴
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特徴
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該当
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A：課題解決型学習（PBL）企業、自治体等との連携あり
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B：課題解決型（PBL）連携なし
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C:討議（ディスカッション、ディベート等）
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○
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D:グループワーク
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○
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E:プレゼンテーション
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○
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F：実習、フィールドワーク
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G：双方向授業（ICT活用なし：対話型、リアクションペーパー等）
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○
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H：双方向授業（ICT活用あり：クリッカー、manaba等）
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I：反転授業
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J:外国語のみで行われる授業
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授業計画
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第1回
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遺伝子の構造
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第2回
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タンパク質の構造
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第3回
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遺伝子データベース
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第4回
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ゲノムデータベース
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第5回
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ｍＲＮＡデータベース
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第6回
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微生物データベース
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第7回
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ホモロジー解析
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第8回
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系統樹解析
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第9回
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タンパク質立体構造
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第10回
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分子生物学ツール
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第11回
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プライマー設計
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第12回
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スプライシングバリアント解析
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第13回
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de novoデータベース
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第14回
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パスウェイマップ
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授業外学修
予習（事前学修）
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各授業
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各種配布物をＰＤＦで配信する。これらを事前に学習し、授業に参加。
配布資料等に従い事前に学習する（1時間）
授業後のレポート作成を行う（復習、1時間）
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[平均100分]
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授業外学修
復習（事後学修）
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評価方法
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理解度などを問う試験によって評価する。60点～69点は可、70点～79点は良、80点以上は優、90点以上は秀、59点以下は不可とする。また全体の5％以内の優秀者に秀を与えることがある。
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教科書等
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課題に対するフィードバックの方法
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その他
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授業担当者の実務経験の有無
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授業担当者の実務経験の内容
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藤森文啓 (2002) 制御配列情報の機能. バイオインフォマティクスの実際. （村上康文編）pp. 59-70（講談社サイエンティフィク）
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ファイル
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